O endométrio é uma das camadas que constitui o útero e corresponde ao seu revestimento interno. Durante o ciclo menstrual, o endométrio é regenerado ciclicamente através de um processo de descamação e regeneração.
Assim, a endometriose é a designação dada quando as células que constituem o endométrio se encontram fora da sua localização normal. Podendo, por vezes ser encontrado noutros locais do corpo, como por exemplo nas trompas de falópio ou ovários. Às vezes, o tecido endometrial pode ser encontrado em locais mais distantes, como intestinos, pulmões ou articulações.
Durante um ciclo menstrual normal, as alterações hormonais fazem com que o tecido endometrial se desprenda e seja eliminado, na forma de fluxo menstrual, através da vagina. Na endometriose o endométrio ectópico também descama nos diferentes locais onde se encontra, comportando-se como se estivesse dentro do útero. Uma vez que é também afetado pelas mesmas alterações hormonais. Assim, tecido endometrial começa a desprender-se e a sangrar, mas não tem com sair do corpo. O que leva à irritação, inflamação, e dor, à medida em que o sistema imunológico lida com este tecido ectópico.
A prevalência da endometriose é de cerca de 10% da população em idade reprodutiva. Nas mulheres com infertilidade, essa prevalência aumenta para cerca de 25 a 45%.